Metagenomik

CarmenDie Read-basierte Analyse von Metagenomik-Datensätzen ist eine sehr rechenintensive Anwendung. Die leistungsstarke Infrastruktur der IIT GmbH erlaubt eine automatische Auswertung auch großer metagenomischer Datensätze. Für die Analyse ihrer Metagenomdatensätze verwenden wir eine Reihe von etablierten Programmen und Datenbanken, welche für die Erstellung von taxonomischen Profilen (z.B. LCA, MetaCV, RDP usw.) oder für die funktionelle Klassifikation (z.B. COG, Pfam) verwendet werden. Außerdem bieten wir statische Analysen für ihre Metagenomdatensätze an. Ihre Ergebnisse sind über ein Client-Server-System verfügbar.

Komplettiert wird unser Angebot für Metagenomanalysen durch unsere automatisierte Amplikon-Auswertungen, welche Ihnen die Analyse von taxonomischen Profilen und statistischen Berechnungen für ihre Amplikondatasätze bietet.