Komparative Genomik 

EDGAR

Die Software EDGAR ermöglicht es Ihnen, mehrere sequenzierte Genome miteinander zu vergleichen. Dadurch erhalten sie einen schnellen Überblick über die Ähnlichkeit Ihrer sequenzierten Stämme zu öffentlich verfügbaren Referenzgenomen. Neben der Berechnung eines phylogenetischen Baums, sowie des Core- und Pangenoms einer Spezies, stehen ihnen Informationen über Singletons und gruppenspezifische Gene zur Verfügung.

 

Rekonstruktion von Stoffwechselwegen  

CARMENFür die Analyse und Rekonstruktion von metabolischen Stoffwechselwegen beinhaltet das IIT-Angebot die Software CARMEN und weitere etablierte Programme. CARMEN erlaubt die schnelle und automatisierte Konvertierung von Sequenzdaten und Annotationen zu Stoffwechselwegen. Durch diese Analyse werden neue Information über die Stoffwechselvorgänge in einem Organismus generiert.